武当败类白眉道人、冯道德、雷老虎等人勾结清廷，甘受驱使残杀武林中人。方世玉之父母方济亨、苗翠花、胡惠干之父皆为败类所杀。最后武林自相残杀，出现一幕令人怵目惊心的大结局。

故事剧情承接上集，说郭靖与黄蓉来到桃花岛，西毒已带子欧阳克来向黄蓉求婚，黄药师以考试选婿，郭靖获胜得娶黄蓉为妻......

清朝康熙年间，少林俗家弟子洪熙官（李连杰饰）是红花会成员，力图反清复明。洪熙官因被同门师兄马宁儿（计春华饰）出卖，家人被叛徒杀害，幸得幼子文定（谢苗饰）避过大难，洪熙官将马宁儿刺死后与文定浪迹天涯。洪

舞狮在南方武馆非常流行，并自有其规矩，如果在舞狮中逾矩，则很容易引起武馆之间的争执。郑天寿武馆因舞狮遭到挑衅与陆正甫武馆结怨，另一武馆主黄麒英与儿子黄飞鸿出面调停，却未起作用。黄飞鸿与郑氏武馆的王隐林互为好友，二人约定与第三方较量以便分出彼此武功高下，岂料王隐林之妹菊英匆忙中造成误会，导致王隐林受伤，菊英又二话不说向洪飞鸿寻仇……这边的误会刚解除，陆正甫武馆的公子陆山豪用计将王隐林重伤，而陆正甫将之前打伤王隐林的精武门高手单雄（王龙威 饰）迎入武馆，图谋利用单雄的北派功夫打击黄麒英、郑天寿等武馆同行。此时

故事描述，白莲教主（罗烈饰）武功高功高深莫测，却甘作满清鹰犬，暗中消灭反清志士及破坏重建少林寺计划；洪文定（刘家辉饰）为洪熙官之子，曾击毙白之师弟。白夜洪住的反清志士家，洪护著身怀六甲的友妻（惠英红饰）突围逃走……

舞女丧婆（吴家丽 饰），不幸染上毒瘾，被卧底警察阿勇（刘德华 饰）协助她戒毒。两人感情激增之时，阿勇被黑道大哥杀死，丧婆替他报仇而入狱。不料黑社会小头目竟逼其女友马玉凤（马斯晨 饰）进入狱中暗杀丧婆。马玉凤身材瘦小，甫入狱便遭人欺负，屡屡为丧婆出手相救，后来马玉凤知道丧婆是她的暗杀对象时已下不了手。

赌场上人尽皆知的千手大哥泰有得力手下徐强及段志勇， 一次赌局中，两人助泰骗去彪叔巨款，并将部份据为己有,从此种下祸根。.少女Ice Chan误会勇为泰之子，为向泰报杀父之仇，借意亲近勇，勇以为有艳遇，

清朝末年政局腐败，社会民不聊生，慈禧太后与一群愚昧无知的权贵大臣不但毫无抵御外国列强侵占，以及保护人民的能力，反而迷信以吞符念咒，自称无坚不摧的“义和团”可以抵御洋人，决意向列强宣战。结果导致八国联军攻陷北京，慈禧太后仓惶逃难；人民这才醒悟到，只有孙中山先生领导的革命运动，才是挽救中国的唯一希望。

以“反清复明”为号召的天地会，一向被朝廷追捕，天地会怕被清廷一网打尽，于是将会员名册送往机密地点。天地会中人红娘子遇上刚直的捕快阿云，暗中利用他送出名册，期间遇到聪敏的阿寸，两人为生计不惜去踢馆，又参加舞狮比赛。而后红娘子被杀，阿云与阿寸从中醒觉代红执行任务，两人也身受重伤，生命危在旦夕……

香港国际刑警特工队员李卓敏，机场接得国际扫毒专员来港安排一特别任务. 途中遭伏击，专员被劫走，泰缅大毒枭章铁夫致电美国国际刑警总部，以专员交换人质. 任务落在香港特警队长洪彼得身上，洪即电召行动组组长夏振飞及李卓敏等，同时找得善于丛林战的阮志勇，雷军，阿胜等赴毒枭大本营救专员在曼谷街头，一泰女杀手黑天使乔扮卖花女郎枪杀夏振飞，李卓敏追至一废墟，与黑天使展开一场斗智，枪战，拳脚的生死搏斗……