尼奥探寻自己使命背后真相，为自己的行动寻找一个可以接受的理由与此同时，矩阵系统决定先下手为强，派遣了为数25万的电子乌贼大军，开始进攻锡安基地。尼奥他们决定再次潜入矩阵，从内部破坏它。在寻找矩阵系统内